FFU层流罩系统和风机系统配置的洁净系统有什么区别基于对生产成本和系统洁净效果以及稳定性的考虑，现代医药行业的百级洁净层流区域的建设基本上是由FFU层流罩来建造的。而传统的层流罩，由于其存在着一系列难以解决的弊端和缺陷，几乎已经退出了洁净系统的建造主流。
一个风机系统配置的洁净系统与FFU层流罩比较有以下不足：
1、产生层流方面。一个风机送风，由于过滤器与风机的距离有远近之分，其出风面的的风速会有很大差异，所产生的气流是乱流，很难达到层流。而百级区域要求气流严格按照层流方向流动，所以这种方法很难使系统达到的百级和层流效果。
2、风机方面。整个系统只有一台风机，这对风机的要求非常高!一旦风机出故障，整个系统就会陷入瘫痪无法运行，此时应该停产检修。这对于正在生产旺季的厂家来说，会造成一笔的损失!整个洁净系统的投入是无法于这种损失相比较的。而百级洁净区对风机的这种高要求，几乎无法保障风机的可靠性，出问题是无法避免的。
3、寿命方面。此系统中过滤器只能采用压块式安装，再加上不稳定的风速和压力的影响，传统的安装方式会大大降低高效过滤器的寿命。对于系统的维护和成本的投入是非常划不来的。
4、密封性方面。无论是箱体中的中效还是末端的高效，由于固定方式的局限，很容易产生泄漏。气流的泄漏是没有办法弥补的，对于整个系统来说是一个致命的缺陷，将直接影响到保持系统的洁净度，厂家生产会增加生产成本。而一旦产生泄漏，在系统中安装压差表是没有任何意义的。
5、噪声方面。由于风机的高强度运转，噪声非常大，高可达到上百分贝，影响生产环境和工人工作，甚至会危害到工人身体，这对于人是生产力企业来说，无疑是一个不容忽视的问题。
6、维护方面。高效过滤器采用压块式固定方式，而箱体内过滤器为保障其密封性，其更换并不容易，而为保护高效又不得不时常更换，所以维护起来并不象想象中那么简单。
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