通过臭氧消毒可对生物卵消毒、养殖水消毒、设施消毒，可以防止病原体的侵入臭氧具有强烈的杀菌消毒和水质净化作用，无毒无害，是水产养殖和育苗生产中最理想的杀菌消毒净化剂，对防治鱼、虾、海胆、河蟹、甲鱼等生物病害，可以分解有机物，去除COD、BOD物质，又因其助凝作用，对改善水产养殖的生态环境，对养殖水消毒净化有着重要的意义。
可以用臭氧育苗，节约各种消毒剂，抗菌素，可以减少换水量，节约燃料煤，应用臭氧育苗，其成活率至少可提高一倍以上。
一套设备可使用数年，从而既可节省养殖成本，又可培育出绿色环保食品是目前来说最经济实用手段。
臭氧杀菌消毒技术在水产养殖中的优越性：
1、臭氧可以从根本上改善养殖育苗水质、可防治病害，控制赤潮及灭菌消毒等。经臭氧处理后的水可以改善细胞呼吸条件，促进生物生长。用其进行水产育苗和幼鱼培育，可以大幅度降低幼苗死亡率，大大提高鱼、虾、贝类育苗和养殖的成活率。
2、臭氧具有强烈的杀菌消毒和水质净化作用，而且无毒无害，是水产养殖和育苗生产中最理想的杀菌净化剂，对防治鱼、虾、海胆、河蟹、甲鱼等生物病害，改善水产养殖的生态环境起到重要作用。
3、明显提高饲料的转化率，促进生长，提高产量。
4、应用臭氧可降解水中的有机物、氨氮、亚硝酸盐等物质，并杀灭水中的致病菌和浮游生物。
5、避免水质污染，如赤潮的发生;避免因周边养殖池的污染、病毒而造成的交叉感染;避免水质恶化和池底污染。
6、降低消耗，降低生产成本。
7、臭氧设备不用消毒时，可以通过气泵制作氧气给水产供气
8、蛋白分离器投加使用，通过涡轮气泡产生细腻气泡混合汽水
